Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GNEQ9Y223 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GNEQ9Y223 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GNEQ9Y223 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNEQ9Y223 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GNEQ9Y223 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms