Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SCAF8Q9UPN6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAF8Q9UPN6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCAF8Q9UPN6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SCAF8Q9UPN6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCAF8Q9UPN6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCAF8Q9UPN6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAF8Q9UPN6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms