Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP83

COG5, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG5Q9UP83 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
COG5Q9UP83 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COG5Q9UP83 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG5Q9UP83 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG5Q9UP83 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COG5Q9UP83 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
COG5Q9UP83 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG5Q9UP83 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG5Q9UP83 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG5Q9UP83 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG5Q9UP83 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG5Q9UP83 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG5Q9UP83 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG5Q9UP83 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG5Q9UP83 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms