Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX7Q9UNH6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX7Q9UNH6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX7Q9UNH6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX7Q9UNH6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX7Q9UNH6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms