Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNRGQ9UMZ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNRGQ9UMZ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYNRGQ9UMZ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNRGQ9UMZ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYNRGQ9UMZ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms