Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ZNF608Q9ULD9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ZNF608Q9ULD9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ZNF608Q9ULD9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
ZNF608Q9ULD9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
ZNF608Q9ULD9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
ZNF608Q9ULD9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
ZNF608Q9ULD9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
ZNF608Q9ULD9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
ZNF608Q9ULD9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
ZNF608Q9ULD9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ZNF608Q9ULD9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ZNF608Q9ULD9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
ZNF608Q9ULD9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
ZNF608Q9ULD9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
ZNF608Q9ULD9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
ZNF608Q9ULD9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
ZNF608Q9ULD9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ZNF608Q9ULD9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ZNF608Q9ULD9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC43.25■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ZNF608Q9ULD9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ZNF608Q9ULD9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
ZNF608Q9ULD9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ZNF608Q9ULD9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ZNF608Q9ULD9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
ZNF608Q9ULD9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ZNF608Q9ULD9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ZNF608Q9ULD9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
ZNF608Q9ULD9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ZNF608Q9ULD9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
ZNF608Q9ULD9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
ZNF608Q9ULD9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
ZNF608Q9ULD9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ZNF608Q9ULD9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ZNF608Q9ULD9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms