Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
HDAC9Q9UKV0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDAC9Q9UKV0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDAC9Q9UKV0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
HDAC9Q9UKV0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
HDAC9Q9UKV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDAC9Q9UKV0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms