Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPUSD1Q9UJJ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPUSD1Q9UJJ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPUSD1Q9UJJ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPUSD1Q9UJJ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPUSD1Q9UJJ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPUSD1Q9UJJ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPUSD1Q9UJJ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPUSD1Q9UJJ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPUSD1Q9UJJ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPUSD1Q9UJJ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms