Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX20Q9UHI6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX20Q9UHI6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX20Q9UHI6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX20Q9UHI6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX20Q9UHI6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX20Q9UHI6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms