Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMTOR3Q9UHA4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LAMTOR3Q9UHA4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMTOR3Q9UHA4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms