Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SWAP70Q9UH65 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SWAP70Q9UH65 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SWAP70Q9UH65 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SWAP70Q9UH65 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SWAP70Q9UH65 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SWAP70Q9UH65 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SWAP70Q9UH65 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SWAP70Q9UH65 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SWAP70Q9UH65 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SWAP70Q9UH65 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SWAP70Q9UH65 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SWAP70Q9UH65 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SWAP70Q9UH65 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SWAP70Q9UH65 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SWAP70Q9UH65 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SWAP70Q9UH65 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms