Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPS7AQ9UBW8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPS7AQ9UBW8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS7AQ9UBW8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS7AQ9UBW8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS7AQ9UBW8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS7AQ9UBW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS7AQ9UBW8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS7AQ9UBW8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS7AQ9UBW8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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