Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYO1AQ9UBC5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MYO1AQ9UBC5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYO1AQ9UBC5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYO1AQ9UBC5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1AQ9UBC5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms