Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
REREQ9P2R6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
REREQ9P2R6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
REREQ9P2R6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
REREQ9P2R6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
REREQ9P2R6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.39■■■■□ 3.74
REREQ9P2R6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
REREQ9P2R6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
REREQ9P2R6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
REREQ9P2R6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.19■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
REREQ9P2R6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms