Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKD2L1Q9P0L9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PKD2L1Q9P0L9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKD2L1Q9P0L9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKD2L1Q9P0L9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms