Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CWC25Q9NXE8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CWC25Q9NXE8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CWC25Q9NXE8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
CWC25Q9NXE8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CWC25Q9NXE8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms