Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTM9

CUTC, Copper homeostasis protein cutC homolog, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTCQ9NTM9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUTCQ9NTM9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUTCQ9NTM9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUTCQ9NTM9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CUTCQ9NTM9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms