Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF304Q9HCX3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF304Q9HCX3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF304Q9HCX3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms