Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CENPJQ9HC77 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CENPJQ9HC77 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CENPJQ9HC77 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CENPJQ9HC77 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CENPJQ9HC77 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CENPJQ9HC77 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CENPJQ9HC77 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CENPJQ9HC77 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CENPJQ9HC77 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CENPJQ9HC77 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CENPJQ9HC77 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CENPJQ9HC77 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CENPJQ9HC77 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CENPJQ9HC77 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CENPJQ9HC77 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CENPJQ9HC77 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms