Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAP6

LIN7B, Protein lin-7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7BQ9HAP6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN7BQ9HAP6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN7BQ9HAP6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIN7BQ9HAP6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIN7BQ9HAP6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIN7BQ9HAP6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LIN7BQ9HAP6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms