Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1BQ9H9Y6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR1BQ9H9Y6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR1BQ9H9Y6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR1BQ9H9Y6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR1BQ9H9Y6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms