Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHEJ1Q9H9Q4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NHEJ1Q9H9Q4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NHEJ1Q9H9Q4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms