Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP13A3Q9H7F0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP13A3Q9H7F0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP13A3Q9H7F0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP13A3Q9H7F0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP13A3Q9H7F0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms