Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLMPQ9H6B4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLMPQ9H6B4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLMPQ9H6B4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLMPQ9H6B4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLMPQ9H6B4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms