Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V9

CXorf56, UPF0428 protein CXorf56, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf56Q9H5V9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXorf56Q9H5V9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXorf56Q9H5V9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXorf56Q9H5V9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXorf56Q9H5V9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXorf56Q9H5V9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXorf56Q9H5V9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms