Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W9

C11orf54, Ester hydrolase C11orf54, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf54Q9H0W9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C11orf54Q9H0W9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C11orf54Q9H0W9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C11orf54Q9H0W9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf54Q9H0W9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf54Q9H0W9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf54Q9H0W9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf54Q9H0W9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C11orf54Q9H0W9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf54Q9H0W9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C11orf54Q9H0W9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms