Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCOLN1Q9GZU1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCOLN1Q9GZU1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCOLN1Q9GZU1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCOLN1Q9GZU1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MCOLN1Q9GZU1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms