Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CFAP74Q9C0B2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CFAP74Q9C0B2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CFAP74Q9C0B2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
CFAP74Q9C0B2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
CFAP74Q9C0B2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CFAP74Q9C0B2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CFAP74Q9C0B2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CFAP74Q9C0B2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CFAP74Q9C0B2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CFAP74Q9C0B2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CFAP74Q9C0B2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CFAP74Q9C0B2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CFAP74Q9C0B2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CFAP74Q9C0B2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
CFAP74Q9C0B2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CFAP74Q9C0B2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CFAP74Q9C0B2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CFAP74Q9C0B2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CFAP74Q9C0B2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
CFAP74Q9C0B2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CFAP74Q9C0B2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
CFAP74Q9C0B2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CFAP74Q9C0B2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CFAP74Q9C0B2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CFAP74Q9C0B2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CFAP74Q9C0B2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CFAP74Q9C0B2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CFAP74Q9C0B2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms