Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM6Q9C030 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM6Q9C030 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM6Q9C030 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM6Q9C030 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM6Q9C030 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms