Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RTN4RQ9BZR6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RTN4RQ9BZR6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTN4RQ9BZR6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTN4RQ9BZR6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms