Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABARAPL3Q9BY60 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABARAPL3Q9BY60 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABARAPL3Q9BY60 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABARAPL3Q9BY60 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms