Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SGIP1Q9BQI5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SGIP1Q9BQI5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
SGIP1Q9BQI5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SGIP1Q9BQI5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SGIP1Q9BQI5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms