Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC43.55■■■■■ 4.56
IFT140Q96RY7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
IFT140Q96RY7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
IFT140Q96RY7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
IFT140Q96RY7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
IFT140Q96RY7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
IFT140Q96RY7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
IFT140Q96RY7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
IFT140Q96RY7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
IFT140Q96RY7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
IFT140Q96RY7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
IFT140Q96RY7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
IFT140Q96RY7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
IFT140Q96RY7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
IFT140Q96RY7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC43.45■■■■■ 4.55
IFT140Q96RY7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
IFT140Q96RY7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
IFT140Q96RY7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
IFT140Q96RY7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.42■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC43.39■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
IFT140Q96RY7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
IFT140Q96RY7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
IFT140Q96RY7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
IFT140Q96RY7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
IFT140Q96RY7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
IFT140Q96RY7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
IFT140Q96RY7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
IFT140Q96RY7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
IFT140Q96RY7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
IFT140Q96RY7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
IFT140Q96RY7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.51
IFT140Q96RY7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
IFT140Q96RY7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC43.13■■■■■ 4.5
IFT140Q96RY7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.1 ms