Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX1Q96RV3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCNX1Q96RV3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX1Q96RV3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNX1Q96RV3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX1Q96RV3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms