Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GBP4Q96PP9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GBP4Q96PP9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GBP4Q96PP9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GBP4Q96PP9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GBP4Q96PP9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms