Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN5Q96NI6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN5Q96NI6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRFN5Q96NI6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRFN5Q96NI6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms