Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ABCC12Q96J65 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
ABCC12Q96J65 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC12Q96J65 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
ABCC12Q96J65 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ABCC12Q96J65 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms