Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ULK4Q96C45 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ULK4Q96C45 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ULK4Q96C45 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms