Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFHD2Q96C19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFHD2Q96C19 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EFHD2Q96C19 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFHD2Q96C19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFHD2Q96C19 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms