Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CUL5Q93034 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CUL5Q93034 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CUL5Q93034 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CUL5Q93034 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CUL5Q93034 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CUL5Q93034 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CUL5Q93034 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CUL5Q93034 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CUL5Q93034 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CUL5Q93034 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CUL5Q93034 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CUL5Q93034 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CUL5Q93034 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CUL5Q93034 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUL5Q93034 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CUL5Q93034 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CUL5Q93034 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CUL5Q93034 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL5Q93034 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CUL5Q93034 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUL5Q93034 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CUL5Q93034 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms