Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP7Q93009 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP7Q93009 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP7Q93009 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP7Q93009 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP7Q93009 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP7Q93009 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP7Q93009 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP7Q93009 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP7Q93009 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP7Q93009 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP7Q93009 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP7Q93009 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP7Q93009 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP7Q93009 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP7Q93009 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP7Q93009 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP7Q93009 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP7Q93009 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP7Q93009 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP7Q93009 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP7Q93009 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP7Q93009 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP7Q93009 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP7Q93009 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP7Q93009 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP7Q93009 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP7Q93009 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP7Q93009 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP7Q93009 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP7Q93009 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP7Q93009 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP7Q93009 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP7Q93009 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP7Q93009 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP7Q93009 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP7Q93009 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP7Q93009 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP7Q93009 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP7Q93009 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP7Q93009 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP7Q93009 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP7Q93009 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP7Q93009 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP7Q93009 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP7Q93009 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP7Q93009 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP7Q93009 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP7Q93009 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP7Q93009 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP7Q93009 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP7Q93009 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP7Q93009 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP7Q93009 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP7Q93009 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP7Q93009 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP7Q93009 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP7Q93009 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP7Q93009 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP7Q93009 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP7Q93009 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP7Q93009 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP7Q93009 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP7Q93009 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP7Q93009 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP7Q93009 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP7Q93009 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP7Q93009 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP7Q93009 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP7Q93009 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP7Q93009 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP7Q93009 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP7Q93009 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP7Q93009 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP7Q93009 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP7Q93009 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP7Q93009 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP7Q93009 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP7Q93009 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP7Q93009 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP7Q93009 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP7Q93009 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP7Q93009 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP7Q93009 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP7Q93009 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP7Q93009 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP7Q93009 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP7Q93009 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP7Q93009 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms