Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERVK_113Q902F9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HERVK_113Q902F9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HERVK_113Q902F9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HERVK_113Q902F9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HERVK_113Q902F9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms