Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLEC4DQ8WXI8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLEC4DQ8WXI8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms