Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKA2Q8WVK7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKA2Q8WVK7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SKA2Q8WVK7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SKA2Q8WVK7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKA2Q8WVK7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms