Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB33

LINC01560, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01560, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01560Q8TB33 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01560Q8TB33 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC01560Q8TB33 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01560Q8TB33 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC01560Q8TB33 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01560Q8TB33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC01560Q8TB33 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC01560Q8TB33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01560Q8TB33 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01560Q8TB33 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01560Q8TB33 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01560Q8TB33 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01560Q8TB33 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01560Q8TB33 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01560Q8TB33 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LINC01560Q8TB33 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms