Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GADD45GIP1Q8TAE8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GADD45GIP1Q8TAE8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GADD45GIP1Q8TAE8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GADD45GIP1Q8TAE8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GADD45GIP1Q8TAE8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GADD45GIP1Q8TAE8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GADD45GIP1Q8TAE8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GADD45GIP1Q8TAE8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GADD45GIP1Q8TAE8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GADD45GIP1Q8TAE8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GADD45GIP1Q8TAE8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GADD45GIP1Q8TAE8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GADD45GIP1Q8TAE8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GADD45GIP1Q8TAE8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GADD45GIP1Q8TAE8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms