Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO27Q8NI29 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FBXO27Q8NI29 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO27Q8NI29 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO27Q8NI29 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms