Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SVIPQ8NHG7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SVIPQ8NHG7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVIPQ8NHG7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SVIPQ8NHG7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms