Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCPH1Q8NEM0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCPH1Q8NEM0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCPH1Q8NEM0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCPH1Q8NEM0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms