Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG0

FAM71C, Protein FAM71C, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71CQ8NEG0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71CQ8NEG0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71CQ8NEG0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71CQ8NEG0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71CQ8NEG0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM71CQ8NEG0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71CQ8NEG0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71CQ8NEG0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms